Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sfmbt1Q9JMD1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms