Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdc42ep4Q9JM96 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdc42ep4Q9JM96 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms