Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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