Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3aQ9JKX8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms