Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp4Q9JKV5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms