Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb3Q9JKS4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb3Q9JKS4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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