Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx5Q9JKQ4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms