Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms