Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnga3Q9JJZ8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga3Q9JJZ8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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