Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpd3Q9JJY3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smpd3Q9JJY3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms