Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Alyref2Q9JJW6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Alyref2Q9JJW6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Alyref2Q9JJW6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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