Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms