Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Riox1Q9JJF3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Riox1Q9JJF3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Riox1Q9JJF3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Riox1Q9JJF3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Riox1Q9JJF3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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