Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lmbr1Q9JIT0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbr1Q9JIT0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms