Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kcnmb4Q9JIN6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kcnmb4Q9JIN6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms