Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA1

Lgi1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi1Q9JIA1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgi1Q9JIA1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lgi1Q9JIA1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms