Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhl1Q9JI74 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl1Q9JI74 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms