Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pus3Q9JI38 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pus3Q9JI38 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pus3Q9JI38 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pus3Q9JI38 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pus3Q9JI38 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pus3Q9JI38 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pus3Q9JI38 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pus3Q9JI38 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pus3Q9JI38 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms