Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtaQ9JHK4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
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