Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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OtofQ9ESF1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms