Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hipk3Q9ERH7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms