Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb3Q9ERD7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb3Q9ERD7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms