Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capn12Q9ER56 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms