Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rapgef4Q9EQZ6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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