Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tlr9Q9EQU3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tlr9Q9EQU3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms