Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms