Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sil1Q9EPK6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms