Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl4Q9DCU6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl4Q9DCU6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms