Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Tspan4Q9DCK3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Tspan4Q9DCK3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Tspan4Q9DCK3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Tspan4Q9DCK3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Tspan4Q9DCK3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tspan4Q9DCK3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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