Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms