Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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