Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc46a3Q9DC26 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms