Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc97Q9DBT3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms