Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Smg9Q9DB90 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms