Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pop5Q9DB28 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms