Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc89Q9DA73 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms