Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Subh2bvQ9D9Z7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Subh2bvQ9D9Z7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Subh2bvQ9D9Z7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Subh2bvQ9D9Z7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Subh2bvQ9D9Z7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Subh2bvQ9D9Z7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Subh2bvQ9D9Z7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Subh2bvQ9D9Z7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Subh2bvQ9D9Z7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Subh2bvQ9D9Z7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Subh2bvQ9D9Z7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Subh2bvQ9D9Z7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Subh2bvQ9D9Z7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Subh2bvQ9D9Z7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Subh2bvQ9D9Z7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Subh2bvQ9D9Z7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Subh2bvQ9D9Z7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Subh2bvQ9D9Z7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Subh2bvQ9D9Z7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Subh2bvQ9D9Z7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Subh2bvQ9D9Z7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Subh2bvQ9D9Z7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Subh2bvQ9D9Z7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms