Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms