Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rexo2Q9D8S4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms