Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc52a2Q9D8F3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc52a2Q9D8F3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms