Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rep15Q9D7T1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rep15Q9D7T1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rep15Q9D7T1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rep15Q9D7T1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rep15Q9D7T1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rep15Q9D7T1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rep15Q9D7T1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rep15Q9D7T1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rep15Q9D7T1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rep15Q9D7T1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rep15Q9D7T1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rep15Q9D7T1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rep15Q9D7T1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rep15Q9D7T1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rep15Q9D7T1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rep15Q9D7T1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rep15Q9D7T1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rep15Q9D7T1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rep15Q9D7T1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rep15Q9D7T1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rep15Q9D7T1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rep15Q9D7T1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rep15Q9D7T1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rep15Q9D7T1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rep15Q9D7T1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rep15Q9D7T1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rep15Q9D7T1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rep15Q9D7T1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rep15Q9D7T1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rep15Q9D7T1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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