Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp5Q9D7S9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chmp5Q9D7S9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chmp5Q9D7S9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chmp5Q9D7S9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp5Q9D7S9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp5Q9D7S9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp5Q9D7S9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp5Q9D7S9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp5Q9D7S9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp5Q9D7S9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp5Q9D7S9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp5Q9D7S9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp5Q9D7S9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp5Q9D7S9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp5Q9D7S9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp5Q9D7S9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp5Q9D7S9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp5Q9D7S9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp5Q9D7S9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp5Q9D7S9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp5Q9D7S9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp5Q9D7S9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms