Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms