Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6N1

Ca13, Carbonic anhydrase 13, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca13Q9D6N1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms