Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms