Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930513O06RikQ9D549 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930513O06RikQ9D549 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930513O06RikQ9D549 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930513O06RikQ9D549 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930513O06RikQ9D549 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930513O06RikQ9D549 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930513O06RikQ9D549 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930513O06RikQ9D549 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930513O06RikQ9D549 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930513O06RikQ9D549 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930513O06RikQ9D549 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms