Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms