Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lonrf3Q9D4H7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms