Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubgcp4Q9D4F8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms