Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clvs1Q9D4C9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms